White Rabbit
Herramienta de código abierto desarrollada por OHDSI para el análisis y perfilado de bases de datos fuente previo a la transformación ETL hacia OMOP CDM, generando informes detallados sobre la estructura, contenido y distribución de los datos originales.
Descripción detallada
White Rabbit es una aplicación de escritorio de código abierto mantenida por la comunidad OHDSI que permite escanear bases de datos fuente para generar un informe completo de su estructura y contenido. La herramienta se conecta a bases de datos relacionales (PostgreSQL, SQL Server, Oracle) o ficheros delimitados (CSV) y produce un documento de perfilado que incluye las tablas, campos, tipos de datos, frecuencias de valores y distribuciones estadísticas.
El resultado principal de White Rabbit es un fichero de escaneo que sirve como entrada para Rabbit-in-a-Hat, un módulo complementario que permite diseñar visualmente las especificaciones de mapeo ETL entre las tablas fuente y las tablas destino de OMOP CDM. Este flujo de trabajo estructurado reduce errores de diseño y documenta las decisiones de transformación de forma auditable.
White Rabbit incluye funcionalidades de seudonimización que permiten realizar el escaneo sin exponer datos personales, lo que facilita su uso en entornos hospitalarios con restricciones de privacidad bajo el RGPD.
Aplicación en investigación clínica
En cualquier proyecto de transformación a OMOP CDM, White Rabbit es el primer paso del flujo de trabajo recomendado por OHDSI. Su uso permite a los equipos técnicos comprender la estructura y calidad de los datos fuente antes de invertir recursos en el desarrollo de los pipelines ETL, identificando problemas de calidad, campos vacíos y codificaciones no estándar desde la fase inicial.
¿Cómo puede ayudar Tiviztech?
Tiviztech utiliza White Rabbit como parte de su metodología de auditoría de datos fuente en proyectos de transformación OMOP CDM para hospitales y centros de investigación. Contacte con nuestro equipo para realizar un análisis inicial de sus datos clínicos.